Euroopa Kohus otsustas 12. juulil, et Eesti riigil ei ole õigust nõuda ettevõtetelt muude põllumajandustoodete üleliigsete laovarude eest ELi poolt Eestile määratud trahvi, sest 2003. aasta vastava määruse sätted ei olnud 2004. aasta 1. mai seisuga Euroopa Liidu Teatajas eestikeelsena avaldatud. Kohtuotsuse järgi ei täitnud Euroopa Liidu administratsioon oma kohustust tagada, et vajalikud õigusaktid oleksid liitumise hetkeks eestikeelsena kättesaadavad.
Maksu- ja tolliamet on tänaseks alustanud üleliigsete laovarude maksuteatiste tühistamist neil ettevõtjail, kellel on riigiga üleval kohtuvaidlused. Üleliigse laovaru tasu ära maksnud ettevõtjatele tasu tagastamist ning suhkru üleliigse laovaru tasude tühistamist arutab valitsus järgmisel nädalal. Hetkel on Eestil pooleliolevaid vaidlusi laovarutasu osas kokku 26 juriidilise isikuga summas 27,7 miljonit eurot, millest ettevõtjad on ära maksnud 1,823 miljonit eurot.
Eesti riik on Euroopa Komisjonile alates 2007. aasta jaanuarist tasunud muude põllumajandustoodete (piimatooted, riis, vein) üleliigsete laovarude eest kokku 6,584 miljonit eurot. Suhkru üleliigsete laovarude eest on Eesti tasunud kokku 34,264 miljonit eurot ehk 75 protsenti määratud kogusummast (45,7 miljonit eurot). 25 protsenti määratust oli Eestil lubatud jätta endale kulude katteks, mistõttu ei tulnud seda ühenduse eelarvesse maksta.
Euroopa Komisjon määras 1. mail 2004 Eestile suhkru üleliigse laovaru suuruseks 91 464 tonni, millest 42 731 tonni oli hinnatud üleliigseteks varudeks kodumajapidamistes. Eesti vaidlustas kodumajapidamistes määratud koguse Euroopa Kohtus, kuid kohus kaebust ei rahuldanud. Kokku määras komisjon Eestile suhkru üleliigsete laovarude tasu 45,686 miljonit eurot, millest veerandi võis Eesti endale jätta.
Muude põllumajandustoodete üleliigsete varude kohta tegi Euroopa Komisjon otsuse 4. mail 2007. Sellega määrati Eestile üleliigsete varude (piimatooted, riis, vein) maksumuseks 6,584 mln eurot. Esialgselt (juulis 2005) oli komisjon Eestile arvestanud muude põllumajandustoodete üleliigsete laovarude maksumuseks 23,9 mln eurot , kuid Eesti esitas oma argumendid ning analüüsid, mille tulemusel summat vähendati 6,584 miljonile.
Hetkel on Eestil pooleliolevaid vaidlusi laovarutasu osas kokku 26 juriidilise isikuga summas 27,7 miljonit eurot, millest ettevõtjad on ära maksnud 1,823 miljonit. Muude toodete osas on tasunud ja vaidlustanud kümme ettevõtjat, suhkru puhul on tasunud ja vaidlustanud üheksa ettevõtjat. Osad neist ettevõtjaist ka kattuvad.